中，小智和小豪、小春来到以前小春和樱木所长一起来的森林里露营，但是由于误解，小智和小豪之间的友情遇到了一些问题。
在小春的开导下，小智最后和小豪解除了误会。洛奇亚出现后，小智和小豪向洛奇亚发出了团体战，小智的皮卡丘、路卡利欧，以及小豪的敲音猴、闪焰王牌和千面避役，一起挑战洛奇亚。尽管大家配合默契，无奈洛奇亚实力太过强大，之后小豪试图收服洛奇亚，但是没能成功，大家反而差点被洛奇亚的气旋攻击吹下悬崖，最后被洛奇亚所救，战斗中断。不久后，小智卸任樱木研究所特别调查员身份，和小豪、小春道别，之后和皮卡丘一起踏上了新的旅程，期间与巴大蝶重逢，以及派出路卡利欧和路人训练家的拉普拉斯对战。
之后在启程之风！无尽的道路!!至小智与拉帝欧斯！，小智和皮卡丘在旅途中又经历了不少事情：在森林中救下受伤的拉帝亚斯；和以前的伙伴小霞争夺铁臂枪虾；和天桐一起将小刚从布莉姆温施放的幻象中解救出来并化解了误会；和杰尼龟消防队一起扑灭了仓库街的大火，救出被困的宝可梦；和拉普拉斯等宝可梦一起救出被卡在洞穴中的吼吼鲸；帮助诅咒娃娃找回它曾经的训练家；摧毁火箭队三人组全员集结捕捉皮卡丘的计划；帮助拉帝亚斯救出拉帝欧斯，打败宝可梦猎人。
在彩虹和宝可梦大师！中，回到真新镇的小智在帮助大木博士寻找走失的小火龙时和小茂重逢，面对小茂所问的“成为冠军之后距离宝可梦大师还有多远”这一问题，小智陷入了思考。
和皮卡丘一起躲雨时，小智找到了自己的答案。“成为冠军并非终点，我依然还是一个挑战者；我想和全世界的宝可梦成为朋友，这样一定就是宝可梦大师”，对于何为真正的宝可梦大师，小智给出了这样的回答。雨过天晴，小智看着眼前的彩虹，露出了笑容，坚定了心中的信念，和皮卡丘约定即使成为宝可梦大师也要一直在一起。
之后，小智换上了花子给的新鞋子，和皮卡丘一起，朝着成为心中向往的宝可梦大师的目标，再次踏上无尽的旅途。至此，以小智和皮卡丘为主角的冒险故事正式告一段落，但他们的冒险仍将继续下去。
它为了保护常青森林的波波和比比鸟进化成了大比鸟，并打败烈雀与大嘴雀群。成为了常青森林的波波和比比鸟的队长，为了继续保护同伴们，离开小智。在小智成为宝可梦世界锦标赛冠军后，因波波和比比鸟已经拥有了自保能力，选择回归小智队伍。
已知招式有起风、电光一闪、吹飞和舍身冲撞。